Una proteína que estabiliza los ARNm que supresen el cáncer resulta ser un freno clave para la metástasis del cáncer de mama. Un artículo de Core Investigator @genophoria and lab in @ScienceAdvances rastrea el mecanismo de la desintegración del ARN y una proteína que se une al ARN que la mayoría de los estudios han pasado por alto.

La expresión génica en tumores suele atribuirse a cambios genéticos y epigenéticos. Pero cuando el equipo perfiló las tasas de desintegración del ARN en seis líneas celulares de cáncer de mama, la transcripción por sí sola dejaba una gran parte de la variabilidad de la expresión sin explicar. Esa brecha apuntaba a la estabilidad del ARNm.

Para mapear los reguladores detrás de esto, el equipo desarrolló GreyHound, un modelo de aprendizaje profundo que predice la estabilidad de los transcritos a partir de características de secuencias de ARN y la expresión simultánea de proteínas de unión al ARN (RBP) entre tipos celulares.

El principal regulador previsto era RBMS3. CLIP-seq confirmó la unión directa en elementos 3'UTR ricos en AUA; Los ensayos de reporteros mostraron que esos sitios son necesarios y suficientes; SLAM-seq confirmó que el efecto es post-transcripcional, no transcripcional.

Funcionalmente, la pérdida de RBMS3 aumentó la colonización pulmonar metastásica en dos modelos independientes de xenoinjertos. Un análisis CRISPRi in vivo identificó entonces TXNIP, un supresor tumoral, como el efecto clave. Los experimentos de epistas confirmaron que RBMS3 actúa aguas arriba de TXNIP para suprimir la metástasis.

El Laboratorio Goodarzi está contratando a un investigador postdoctoral conjunto. Ver Roles abiertos en Arc: