Pokémon Winds and Waves var opprinnelig planlagt å inkludere mange MMO-lignende funksjoner. Hotelllobbyen fungerte som en slags pseudo-MMO-lobby med mange spillere, og raidene var også planlagt for å skaleres til mange spillere. Mange av disse konseptene ble skrinlagt fordi spillet ble for ambisiøst, og nå utvikler Game Freak et eget flerregion-MMORPG for å bruke dem.