Uma proteína que estabiliza mRNAs supressores do câncer acaba sendo um freio chave para a metástase do câncer de mama. Um artigo do Core Investigator @genophoria and lab in @ScienceAdvances traça o mecanismo do decaimento do RNA e de uma proteína de ligação ao RNA que a maioria dos estudos ignorou.

A expressão gênica em tumores é tipicamente atribuída a mudanças genéticas e epigenéticas. Mas quando a equipe perfilou as taxas de decaimento do RNA em seis linhagens celulares de câncer de mama, a transcrição sozinha deixou uma grande parte da variabilidade da expressão inexplicada. Essa lacuna apontava para a estabilidade do mRNA.

Para mapear os reguladores por trás disso, a equipe desenvolveu o GreyHound, um modelo de aprendizado profundo que prevê a estabilidade dos transcritos a partir das características da sequência de RNA e a expressão simultânea de proteínas de ligação ao RNA (RBP) entre os tipos celulares.

O principal regulador previsto era o RBMS3. O CLIP-seq confirmou ligação direta em elementos 3'UTR ricos em AUA; Ensaios de repórteres mostraram que esses locais são necessários e suficientes; O SLAM-seq confirmou que o efeito é pós-transcritivo, não transcricional.

Funcionalmente, a perda de RBMS3 aumentou a colonização pulmonar metastática em dois modelos independentes de xenoenxertos. Uma triagem in vivo com CRISPRi então identificou o TXNIP, um supressor tumoral, como o principal efetor. Experimentos de epistasis confirmaram que o RBMS3 atua a montante do TXNIP para suprimir metástases.

O Laboratório Goodarzi está contratando um pesquisador de pós-doutorado conjunto. Veja papéis abertos no arco: