Pokémon Winds and Waves var ursprungligen planerat att inkludera många MMO-liknande funktioner. Hotellets lobby fungerade som en slags pseudo-MMO-lobby med många spelare och raider var också planerade att skalas till många spelare. Många av dessa koncept skrotades eftersom spelet blev för ambitiöst och nu utvecklar Game Freak ett separat multiregion-MMORPG för att använda dem.